酿酒工程自动化系成立于2017年，是茅台学院设立的第一批系部。

系部现有专职教师36人，其中具有高级职称教师14人，35岁以下青年教师25人，双师型教师20人，具有博士学位的教师7人，教辅人员7人。系部现有自动化、包装工程2个本科专业，在校本科生757人。

系部建有种类齐全、功能先进的实验（训）室20间，专业教学科研仪器设备总资产达1500余万元，生均教学仪器设备值达1.98万元/人。建立了嵌入式系统与仿真实验室、过程控制实验室、现代电气控制实验室、运动控制系统实验室、数/模电实验室、包装材料性能测试实验室、纸包装打样实验室等实验室。

近年来，获批科研课题60余项，其中，国家自然科学基金项目3项，省部级科研项目10余项。发表科技论文80余篇，其中SCI、EI等收录论文10余篇，出版专著和教材3部，获国内外授权专利130余项。

酿酒工程自动化系秉持茅台学院“产教深度融合”的办学特色，先后与茅台集团包装车间、维修保障车间、数字与信息管理部、申仁包装印务有限公司、贵州贤俊龙彩印有限公司、鸭溪循环经济产业园、贵州长征电器成套有限公司、劲牌茅台镇酒业有限公司 、南通裕盛等相关企业联合建立实习实训基地，共同开展产教融合，加强产教合作，实施实践性教学。